伊达政宗庶子也于当夜刺杀伊达政宗于仙台本丸，伊达家陷入混乱；
十一月三日，最上义亲兵败自杀，秀保以清水义清为最上氏家督，继承山形十五万石，仍称山形藩，四弟山野边义忠继承米泽周边十二万石，是为米泽藩，庄内、由利等领地纳入天领，秀保派专人管理；
十一月五日，伊达政宗次子打开仙台城门，迎接蒲生、宇都宫军进城，按照及，秀保将仙台藩六十八万石分成五份，其中天领二十万石，政宗四子瓜分剩余四十八万石；
十一月中，反对大名相继被害或投降，十余藩被肢解至四十藩，仅剩岛津忠恒不愿投降；
十一月二十日，岛津义弘召开评定，废黜忠恒家督之位，开城迎接丰臣军；秀保将佐土原藩肢解为三家，并没收西大隅为天领，“丁巳之乱”平息。
永宁二年
四月中，努尔哈赤以“七大恨”起兵，率军两万攻打抚顺城，后金大胜，连下东州﹑马根单﹑抚顺三城，俘获人畜三十余万；
七月中，努尔哈赤又亲领大军从鸦鹘关入明，攻破了清河城，副总兵邹储贤所部明军被歼；
七月二十一，岛津义弘病逝，其领地被纳为天领；
八月初，秀保得知明军惨败，派遣长子河内光国及藤堂高虎往赴北京，提醒万历帝万不可轻视女真，万历帝是才感慨秀保之忠，听从秀保建议，加强边防，关闭榷场，避免重蹈覆辙，同时决定召集明军、女真叶赫部及日本任那驻军共计十二万攻打后金都城赫图阿拉；与此同时，秀保动员军士两万，准备于图们登陆，百里奔袭，从背后偷袭赫图阿拉；
永宁三年
大纲（庆长六年-永宁三年五月）(8/9)